宿命的相逢之后，佐佐木小次郎（鶴田浩二 饰）苦练技艺，一心打败宫本武藏（三船敏郎 饰）。这之后，小次郎来至江户谋求官职，期间与同在江户的武藏邂逅，两人约定东门决斗。然决斗前夜，武藏致信请求将决斗延期一年。曾几何时，世界上突然出现了无数巨大的巨人，对普通人类的生命构成了前所未有的威胁。为了保护自己的安全，最后的人类建造了三堵高墙：玛丽亚、露丝和希娜。人类迎来了一个长达一个世纪的和平时代，但它也把自己变成了一只圈养的鸟，羞辱了自由的丧失。
