小智和皮卡丘以及他们的同伴在旅途中前进。有一天,宝可梦波尔克尼安从天而降,被迫和小智关在一起。Polkenyon和被人类伤害的宝可梦人住在一起,所以他非常讨厌人类,但这条神奇的链条让他们形影不离,精彩的故事从这里开始。「……我没有名字。一片空无。你叫什么名字?」「我的名字是时崎狂三。」 失忆少女「空无」在所谓邻界之地清醒,邂逅了时崎狂三。 她跟着狂三来到一所学校,里面聚集了一群被称为准精灵的少女。