高中女生奈绪(名冢佳织 配音)隶属摄影部,她喜欢捕捉云和风。一天,她在学校天台拍照时,看见一只飞天猫,随即天空居然下起了“猫雨”,震惊之余她不慎失足坠楼。出乎意料的是,从高空中摔下的她竟毫发无损。主人公与同伴为了确认这一传言是否属实,不料被拉进了异空间,在那里被称为暗影的怪物袭击,与怪物接触时主角一行人的Persona能力觉醒。为了掘开深夜电视与连续杀人事件之间的关系,以及避免其他人被卷入该事件,他们组成了特别搜查队展开了战斗。