让那如同燃烧宝石般的光辉 让那如同闪亮彩虹般的每个幸福之日，再一次—— 被那份眩目囚禁的奈奈，参加了长颈鹿主办的谜之选拔。 成为合格者的她，期盼着在命运舞台上的「第99回圣翔祭，那一年间的再演」。 「好吧」 然后再次开始的，「那一年」。 奈奈将开花结果的才能，全部投入到那眩目之日的「再演」中。 但她尚未知晓。 没有完全相同的舞台。 没有不会结束的舞台。 在重复的再演前方，旋转的轮舞开幕。 「本该是演出过的舞台。但，却是我不知道的舞台」 「那就是，轮舞·轮舞·轮舞——我明白的」
美绪介绍下，他们认识以画富士山闻名的画师如月峰水、市议员大木岩松、双塔的设计者风间英彦（森谷帝二的弟子，第一弹《引爆摩天楼》中，森谷曾向新一挑战）、天才程序员原。期间灰原的举动异常。 大木提前入住B塔被害，目暮警官着手调查发现他与美绪似有不同寻常关系，不久原亦被杀害于家中。因为现场都留有与日本画画师作画时所用的乳钵相似的小酒杯碎片，两起案件似系一人所为。柯南由小酒杯联想到灰原曾效力的、以酒名为绰号的黑暗组织，并注意到第二起案件中碎片上未沾染血迹。与此同时他找到灰原举动异常的原因，却发现她正被人追踪。而园子玩笑弄的发式令她像极了雪莉（灰原）。 开幕酒会上，美绪向宾客展示如月最为宝贵的富士山画作时被杀，死相正如横亘在富士山正中的双塔的缩影图，她的身下也有一个小酒杯，不过却是完好的。地上一颗原本该呆在美绪脖子上的珍珠令柯南将目光转向如月。紧接，A楼美绪公司电脑档案所在的楼层及地下配电室发生爆炸。逃亡时刻，柯南注意到正有一支枪瞄准园子，心中给出了所有疑问的答案，但他及小兰等人最迫切需要解决的却是如何从火海逃脱。
这个“国家”隐藏着一些东西——自从“地下”的激烈战斗结束以来，森罗和他的团队已经意识到了“传教士”的野心。他们的目标是召集“安得拉爆炸”的所有所有者，重现250年前发生的巨大灾难，摧毁世界。
