一日放学的途中,志贵遇见了一名白衣女子,体内突然产生的杀意让志贵措手不及,还未反应过来便将女子切成了碎片。第二天,本该死去的女子却站在志贵的面前,她告诉志贵,自己叫做艾尔奎特(生天目仁美 配音),是拥有不死之身的吸血鬼,一直追踪并企图消灭死徒罗阿(三宅健太 配音)。志贵的攻击让艾尔奎特的身体极度衰弱,因为,在恢复之前,志贵必须肩负起保护她安全的职责。 在目睹了罗阿的暴行之后,志贵决定加入消灭罗阿的队伍中去。同时,教会的雪露(折笠富美子 配音)也同罗阿有着难解之仇。在追踪罗阿的过程中,志贵渐渐发觉有一些非比寻常的记忆正在脑海中苏醒,一直坚信着的自己的过去,竟然是一个骗局。
在经过了「女皇之刃 流浪的戰士」以及「女皇之刃 王位的繼承者」,第三季的动画已确定为「女皇之刃 叛乱」,这次的故事可是建基于「女皇之刃」原作的第二系列第一作「叛乱的骑士姬」,所以这次的主角将会是由骑士公主安妮洛特担任。