一次偶然中,真宫樱遇见了名为六道轮回(石川界人 配音)的少年,敏感的樱很快就发现了少年的半人半神的真实身份。 原来, 六道轮回拥有着一半的死神血统,因此而肩负着超度亡灵的重任,他的正直和善良吸引了樱的注意,两人联手,将一个又一个无法安息的亡魂送入了轮回之轮。随着时间的推移,樱渐渐发现,原来六道轮回的奶奶魂子(雪野五月 配音)正是曾经救过自己性命的死神,而她特殊的命运早在那一刻就已经决定。
刚刚大学毕业的男子拓治(三浦友和 饰)爱上了从小成长在深山之中的女孩清乃(山口百惠 饰),两人越过了重重阻碍,最终结为夫妻,然而,在两人刚刚结婚没多久,战争就爆发了,拓治扛起枪走上了战场,并且不幸的在战争中身负重伤,被送回了家。
剧场版将沿用第二季末的剧情,新的天使机器人风音日和将正式出现在剧场版中。风音日和是智深的第四个天使机器人后宫,也是四个天使机械人中最温柔、最害羞、最有女人味的一个。他也是直树发誓永远不会忘记的人。