幕府时代末期，外忧外患，山川动荡。人民的生活很艰难，他们的生命不断受到威胁。年轻的心太被他善良纯洁的心所打动，成为了飞天剑流的大师。他被他招募来学习剑术，并改名为剑心。
一段深信“星星”存在的少年．鲁必奇与垃圾人．普佩，为了守护希望与梦想的冒险故事。父亲总是告诉鲁必奇，在与世隔绝、烟雾迷漫的烟囱小镇上空另一侧有著“星星的存在”，为了找出“真相”，鲁必奇与普佩展开一场大冒险。
三桥贵枝利用转学的机会，决定在新学校成为一名不良少年。为了在同学中获得存在感，他甚至去美发沙龙做了一头金色的卷发。和他转学到同一所学校的伊藤也有同样的想法。开学第一天，伊藤和三桥就发现了对方的秘密，于是结成了联盟。
